«Σχεδιασμός ιχνηθετών και evo–devo προσέγγιση συγκεκριμένων δομών του Κεντρικού Νευρικού Συστήματος των χορδωτών»
ΝΙΚΗΣΤΡΑΤΟΣ ΣΙΣΚΟΣ, Μεταδιδακτορικός ερευνητής, Τμήμα Μοριακής Βιολογίας & Γενετικής, ΔΠΘ
ΑΝΔΡΕΑΣ-ΡΑΦΑΗΛ ΒΑΣΙΛΕΙΟΥ, Υποψήφιος Διδάκτορας, Τμήμα Μοριακής Βιολογίας & Γενετικής, ΔΠΘ
- Περιεχόμενο
- Στο σημείο τομής της Αναπτυξιακής Βιολογίας, της Νευροβιολογίας και της Εξελικτικής Βιολογίας, αναδεικνύεται η σημασία της συγκριτικής ανάλυσης εμβρύων διαφόρων ζωικών ειδών, προκειμένου να μελετηθούν οι αναπτυξιακοί μηχανισμοί, αλλά και το αρχιτεκτονικό σχέδιο δόμησης του κεντρικού νευρικού συστήματος. Στο παρόν workshop θα επιχειρηθεί ο σχεδιασμός κατάλληλων εκκινητών για τη διενέργεια PCR, προκειμένου να κλωνοποιηθεί ένα σύνολο ιχνηθετών, με στόχο τη διενέργεια υβριδοποίησης in situ. Ο σχεδιασμός περιλαμβάνει τη μελέτη των υποψήφιων γονιδίων σε διάφορα ζωικά είδη και την επιλογή κατάλληλων εκκινητών. Ακολούθως θα συζητηθούν οι βασικές αρχές της μεταγραφής in vitro και της υβριδοποίησης in situ, ενώ θα μελετηθεί έτοιμο υλικό (φωτογραφίες) με στόχο την προσέγγιση των αναπτυξιακών/εξελικτικών μηχανισμών και του αρχιτεκτονικού σχεδίου δόμησης ειδικών περιοχών του αναπτυσσόμενου ΚΝΣ.
- Στόχοι
- Εξοικείωση με τη σχέση μεταξύ της Βιολογίας της Ανάπτυξης και της Εξελικτικής Βιολογίας. Σχεδιασμός ιχνηθέτη για τη διεξαγωγή υβριδοποίησης in situ. Σχεδιασμός εκκινητών για τη διεξαγωγή PCR μεταξύ διαφόρων ζωικών ειδών. Αξιολόγηση αποτελεσμάτων πειραμάτων υβριδοποίησης in situ (μελέτη φωτογραφιών).
- Προαπαιτούμενες γνώσεις
- Εξοικείωση με τη βιολογία της ανάπτυξης του κεντρικού νευρικού συστήματος. Εξοικείωση με βασικά υπολογιστικά εργαλεία στοίχισης αλληλουχιών (BLAST, Clustal) και τους τρόπους αναζήτησης αλληλουχιών στη GeneBank.
- Για το workshop απαιτείται
- Κάθε συμμετέχον άτομο προσκομίζει τον προσωπικό του Η/Υ. Δεν απαιτείται εγκατάσταση ειδικού λογισμικού, πλην ενημερωμένης εφαρμογής φυλλομετρητή (browser) με ικανότητα επίσκεψης στους ιστότοπους των NCBI και EMBL, καθώς και εφαρμογής σημειωματαρίου.
- Υλικό προετοιμασία που θα σταλεί στους συμμετέχοντες ηλεκτρονικά
Περιορισμός έτους: 3ο+ έτος
Μέγιστος Αριθμός Συμμετεχόντων: 12 άτομα
Διάρκεια: 2,5 ώρες
