Εισαγωγή στα εργαλεία AlphaFold και PyMOL: Από τη Θεωρία στην Πρακτική Εφαρμογή

Περιγραφή

«Εισαγωγή στα εργαλεία AlphaFold και PyMOL: Από τη Θεωρία στην Πρακτική Εφαρμογή»  

Ιωάννης-Βασίλειος Ελαφρόπουλος, Προπτυχιακός Φοιτητής του τμήματος Βιολογικών Εφαρμογών και Τεχνολογιών, Πανεπιστημίου Ιωαννίνων Δημήτριος Μπλάκος: Προπτυχιακός Φοιτητής του τμήματος Βιολογικών Εφαρμογών και Τεχνολογιών, Πανεπιστημίου Ιωαννίνων

• Περιγραφή
  • Το workshop μας θα επικεντρωθεί στα AlphaFold και PyMOL, δύο ισχυρά εργαλεία που χρησιμοποιούνται ευρύτατα στη δομική βιολογία και όχι μόνο για τη μελέτη της πρωτεϊνικής δομής. Θα περιλαμβάνει:
    • 1. Εισαγωγή στο θεωρητικό υπόβαθρο των εργαλείων, με έμφαση στις βιολογικές τους εφαρμογές, και στις βασικές αρχές πρόβλεψης πρωτεϊνικών δομών.
    • 2. Παρουσίαση του AlphaFold και των δυνατοτήτων του.
    • 3. Χρήση του PyMOL για την οπτικοποίηση και την ανάλυση πρωτεϊνικών δομών.
    • 4. Διαδραστική εξερεύνηση όπου οι συμμετέχοντες θα επεξεργαστούν συγκεκριμένη πρωτεΐνη.
    • 5. Ανοιχτή συζήτηση και Q&A session, όπου θα συζητηθούν απορίες και θα γίνει ανατροφοδότηση της κατανόησης του υλικού.
• Στόχοι
  • Κατανόηση της σημασίας της πρόβλεψης πρωτεϊνικών δομών.
  • Ανάπτυξη πρακτικών δεξιοτήτων στη χρήση των AlphaFold και PyMOL.
  • Εξοικείωση με τα εργαλεία ανάλυσης και οπτικοποίησης πρωτεϊνικών δεδομένων.
  • Βελτίωση της κατανόησης μέσω ενεργής συμμετοχής και αλληλεπίδρασης
• Προαπαιτούμενες γνώσεις
  • Βασικές γνώσεις μοριακής βιολογίας και βιοχημείας.
  • Εξοικείωση με έννοιες πρωτεϊνικής δομής.
  • Δεν απαιτείται προηγούμενη εμπειρία σε βιοπληροφορικά εργαλεία

Περιορισμός έτους: 4ο+ εξαμήνου

Μέγιστος Αριθμός Συμμετεχόντων: 20 άτομα

Διάρκεια: 2 ώρες